Asociacijos kolegialus valdymo organas – Valdyba. Ją sudaro ne mažiau kaip 9 nariai, kuriuos vienerių metų kadencijai renka ir tvirtina LIONS klubų Konferencija.
2019-2020 m. Lietuvos LIONS klubų asociacijos valdybos nariai:
Gubernatorius Almantas Pėstininkas, Kauno Tauro LIONS klubas
I vicegubernatorė Daiva Grikšienė, Šiaulių moterų LIONS klubas
II vicegubenatorius Andrius Stasiukynas, Alytaus Dzūkijos LIONS klubas
Valdybos narys (PDG) Gintautas Piragius, Vilniaus Vytauto Didžiojo LIONS klubas
Valdybos narė Audronė Balčiūnienė, Jurbarko LIONS klubas
Valdybos narė Jolanta Gulbinienė, Kauno M. K. Čiurlionio LIONS klubas
Valdybos narys Valdemaras Guzaitis, Šiaulių LIONS klubas
Valdybos narys Audrius Remeikis, Užpalių LIONS klubas
Valdybos narė Sigita Skarupskienė, Kėdainių moterų LIONS klubas
